Da progetto, l’attuale stazione di Vanzago sarà trasformata in fermata, così come per la Stazione di Legnano e come la nuova fermata di Nerviano.

Siccome i binari per i treni pendolari saranno il 2 e il 3 (mentre l’1 e il 4 saranno utilizzati per i treni lunga percorrenza e per i merci) non ci sarà più il marciapiede attuale lato binario 1 ma si potrà accedere ai treni tramite sottopassi e ascensori sia per andare in direzione Milano o in direzione Gallarate. A tal proposito verrà sistemata la banchina centrale che sarà spostata di circa 110 metri più verso Milano.

Infine nel progetto attuale non sono previsti né la sala d’attesa, né il bagno, né il bar.